Projekt

Daten zum Projekt

Deep learning techniques for association studies of transcriptome and systems dynamics in tissue morphogenesis

Initiative: zukunft.niedersachsen (nur ausgewählte Ausschreibungen)
Ausschreibung: Big Data in den Lebenswissenschaften der Zukunft
Bewilligung: 28.05.2019

Projektinformationen

In dieser Initiative arbeiten WissenschaftlerInnen aus Informationstheorie, Theoretischer Neurowissenschaft, Transkriptomik sowie Zell- und Entwicklungsbiologie zusammen, um erstmals Bildgebungs- und Expressionsdaten zu kombinieren und so die Zusammenhänge zwischen der Genexpression einzelner Zellen und dem Verhalten von Zellverbünden zu verstehen. Ziel ist die Automatisierung der dynamischen Geweberekonstruktion aus großflächigen Live-Bildgebungsdaten mittels Deep-Learning für die Echtzeit-Identifikation von Einzelzellen an Schlüsselstellen des Embryos und deren transkriptomischer Analyse.

Projektbeteiligte

  • Prof. Dr. Jörg Großhans

    Universität Göttingen
    Fachbereich Medizin
    Institut für Entwicklungsbiochemie
    Göttingen

  • Prof. Dr. Fred Wolf

    Max-Planck-Institut für Dynamik und
    Selbstorganisation
    Abt. Nichtlineare Dynamik
    Forschergruppe Theoretische Neurophysik
    Göttingen

  • Prof. Dr. Michael Wibral

    Universität Göttingen
    Fakultät für Biologie und Psychologie
    Campus Institut für Dynamik biologischer Netzwerke
    Göttingen

  • Dr. Gabriela Salinas

    Universitätsmedizin Göttingen
    Georg August Universität
    University Medical Center Göttingen
    NGS Core Unit for Integrative Genomics (NIG)
    Institute for Human Genetics
    Göttingen