Projekt

Das Vorhaben zielt darauf ab, strukturelle Daten zu modularen Polyketidsynthasen (PKS) zu validieren, die 2014 in Nature publiziert wurden. PKS sind wichtige Proteine des rationalen Designs für die biotechnologische Herstellung von pharmazeutisch aktiven Substanzen. Die 2014 publizierte Struktur ist fundamental anders als die bisherige Vorstellung es vermuten ließ. Vor allem wurde auch ein neuer Mechanismus publiziert, der eine andere Arbeitsweise der modularen PKS vorschlägt als bisher angenommen. Über die Methode der Crosslinking-Massenspektrometrie und über Affinitätsassays soll nun herausgefunden werden, welche Domänen bei der Aneinanderlagerung der Module interagieren. Zudem sollen über Mutationen die Interaktionsstellen validiert werden. Die Bindungskonstanten werden über die Technologie des Alpha-Screens bestimmt. Diese Methode ist für große Proteine beschrieben und sie soll für PKS und Untereinheiten von PKS aufgebaut werden. Modulpaare, die sich gut eignen, sollen anschließend über strukturbiologische Verfahren charakterisiert werden. Es werden dazu auch Methoden angewandt, die Konformationen von Proteinen einschränken.

• Dr. Martin Grininger

  Universität Frankfurt am Main
  Institut für Organische Chemie und Chemische
  Biologie
  Buchmann Institute for Molecular Life Sciences
  Frankfurt am Main